НОВІ ГЕРМІНАЛЬНІ МУТАЦІЇ У ГЕНАХ BRCA1, ATM, MUTYH ТА RAD51D У ТУВИНСЬКИХ ХВОРИХ НА РАК МОЛОЧНОЇ ЗАЛОЗИ МОЛОДОГО ВІКУ
DOI:
https://doi.org/10.32471/exp-oncology.2312-8852.vol-43-no-1.15587Ключові слова:
BRCA, гермінальна мутація, рак молочної залози, тувинці, монголоїдна раса.Анотація
Росії щорічно більше ніж у 50 000 жінок виявляють рак молочної залози (РМЗ). Росія — багатонаціональна країна, на її території проживає близько 200 етнічних груп. Серед хакасів, бурятів, тувинців та деяких інших етнічних груп темпи зростання захворюваності на РМЗ більш високі, а вік, у якому вперше діагностують РМЗ, молодший у порівнянні з європеоїдними етносами. Ми зосередилися на тувинському етносі з метою виявити специфічні генетичні аберації, пов’язані з РМЗ. Для цієї етнічної групи поки ще не розроблені моделі профілактики РМЗ та стандарти лікування спадкового РМЗ. У цьому контексті актуальним є пошук генетичних маркерів для раннього виявлення раку і розробка критеріїв відповіді на терапію. Мета: визначити спадкові мутації в генах, що асоційовані з РМЗ у тувинських жінок. Матеріали та методи. У дослідження було включено 24 пацієнтки з РМЗ молодого віку (від 25 до 46 років). Геномна ДНК, виділена зі зразків крові, була використана для підготовки бібліотек з використанням набору для захоплення та збагачення цільових послідовностей, що включає 27 генів (ATM, APC, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CHEK2, EPCAM, FAM175A, MLH1, MRE11A, MSH2, MSH6, MUTYH, NBN, PALB2, PIK3CA, PMS2, PMS2CL, PTEN, RAD50, RAD51C, RAD51D, STK11, TP53 та XRCC2). Секвенування нового покоління було проведено з використанням системи Illumina NextSeq500. Результати: У нашому дослідженні виявлено одну патогенну мутацію в гені BRCA1 (rs80357868) (частота 4%, 1/24). Ми визначили транкуючу мутацію 3875_3878delGTCT гена BRCA1 у тувинської хворої на РМЗ у віці 34 років. Ми також виявили три мутації, які, ймовірно, є пошкоджуючими за PolyPhen2 та/або шкідливими за SIFT у генах ATM (rs781023264), MUTYH (rs199840380) та RAD51D (rs145309168). Висновок: Уперше, наскільки нам відомо, описано високопатогенний варіант гена BRCA1 (rs80357868) та, імовірно, пошкоджуючі (PolyPhen2) гермінальні варіанти в генах ATM (rs781023264), MUTYH (rs199840380) і RAD51D (rs145309168) у тувинських хворих на РМЗ молодого віку.
Посилання
Zhuikova LD, Choynzonov EL, Ananina OA. Cancer incidence in Siberia and Russian Far East. Siberian J Oncol 2019; 18: 5–11 (in Russian).
Sokolenko AP, Preobrazhenskaya EV, Aleksakhina SN, et al. Candidate gene analysis of BRCA1/2 mutation-negative high-risk Russian breast cancer patients. Cancer Lett 2015; 359: 259–61.
Cherdyntseva NV, Pisareva LF, Panferova YV, et al. Ethnic aspects of hereditary breast cancer in the region of Siberia. Vestnik Ros Akad Med Nauk 2014; 69: 72–9 (in Russian).
Butler JM. DNA Extraction Methods. In: Advanced Topics in Forensic DNA Typing: Methodology. Academic Press, 2012. p. 29–47.
McKenna A, Hanna M, Banks E, et al. The Genome Analysis Toolkit: a MapReduce framework for analyzing next-generation DNA sequencing data. Genome Res 2010; 20: 1297–303.
DePristo MA, Banks E, Poplin R, et al. A framework for variation discovery and genotyping using next-generation DNA sequencing data. Nat Genet 2011; 43: 491–8.
Van der Auwera GA, Carneiro MO, Hartl C, et al. From FastQ data to high confidence variant calls: the Genome Analysis Toolkit best practices pipeline. Curr Protoc Bioinformatics 2013; 43: 11.10.1–33.
Chen Z, Zhang Y, Fan A, et al. Brief communication: Y-chromosome haplogroup analysis indicates that Chinese Tuvans share distinctive affinity with Siberian Tuvans. Am J Phys Anthropol 2011; 144: 492–7.
Kiseleva OA, Robustova OV, Bessmertny AM, et al. Prevalence of primary glaucoma in representatives of different races and ethnic groups in Russia and in CIS. Oftalmologia 2013; 10: 11–5 (In Russian).
Nakamura S, Kwong A, Kim SW, et al. Current status of the management of hereditary breast and ovarian cancer in Asia: First report by the Asian BRCA Consortium. Public Health Genomics 2016; 19: 53–60.
Bhaskaran SP, Chandratre K, Gupta H. Germline variation in BRCA1/2 is highly ethnic-specific: Evidence from over 30,000 Chinese hereditary breast and ovarian cancer patients. Int J Cancer 2019; 145: 962–73.
Gaj P, Kluska A, Nowakowska D, et al. High frequency of BRCA1 founder mutations in Polish women with nonfamilial breast cancer. Fam Cancer 2012; 11: 623–8.
Deng S, Wang Y, Ke Y, et al. Analysis of the mutations of BRCA1 in 9 familiar breast cancer patients. Beijing Da Xue Xue Bao Yi Xue Ban 2003; 35: 373–6 (in Chinese).
Kim H, Cho DY, Choi DH, et al. Characteristics and spectrum of BRCA1 and BRCA2 mutations in 3,922 Korean patients with breast and ovarian cancer. Breast Cancer Res Treat 2012; 134: 1315–26.
Liu X, Li H, Shao B, et al. Identification of recurrent BRCA1 mutation and its clinical relevance in Chinese triple-negative breast cancer cohort. Cancer Med 2017; 6: 547–54.
Lek M, Karczewski KJ, Minikel EV, et al. Exome Aggregation Consortium. Analysis of protein-coding genetic variation in 60,706 humans. Nature 2016; 536: 285–91.
Wickramanayake A, Bernier G, Pennil C, et al. Loss of function germline mutations in RAD51D in women with ovarian carcinoma. Gynecol Oncol 2012; 127: 552–5.
Lin PH, Kuo WH, Huang AC, et al. Multiple gene sequencing for risk assessment in patients with early-onset or familial breast cancer. Oncotarget 2016; 7: 8310–20.
Ellis D, Greenman J, Hodgson S, et al. Low prevalence of germline BRCA1 mutations in early onset breast cancer without a family history. J Med Genet 2000; 37: 792–4.
##submission.downloads##
Опубліковано
Як цитувати
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2023 Експериментальна онкологія
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.
